上海研谨生物专业销售(pBM18A Toposmart Cloning Kit 克隆试剂盒)欢迎您咨询订购!
产品信息:
产品介绍:
pBM18ATopotsmart克隆试剂盒利用痘苗病毒的拓扑异构酶I(Topoisomerase I)的切割再连接的特点将片段克隆到载体中,不仅适用于克隆由Pfu、KOD、Xerox、Phusion和Q5等高保真DNA聚合酶扩增的平末端PCR产物,也可克隆由Taq、Tth和klenTaq等DNA聚合酶扩增的带A尾的PCR产物。阳性克隆可用M13F(-47)和M13R(-48) 引物进行菌落PCR鉴定。SmaI和XhoI单酶切可将克隆片段酶切出来。载体的多克隆位点两侧具有SP6和T7 RNA聚合酶启动子序列, 可用于体外RNA转录。载体不含LacZ基因,不能进行蓝白斑筛选。
2. PCR 引物 5’端不能进行磷酸修饰,普通商业化引物即可。
3. 载体采用了新的制备工艺,无需蓝白斑筛选。
4. 载体具有氨苄青霉素抗性。操作步骤
产品信息:
组分 | JCL073-01 (20次) | JCL073-02 (20次×3) |
pBM18A Vector (20ng/ml ) | 20ml | 20ml×3 |
10×Toposmart | 20ml | 20ml×3 |
Control Insert LacZα | 5ml | 5ml |
M13F(-47) Primer | 0.1OD | 0.1OD×3 |
M13R(-48) Primer | 0.1OD | 0.1OD×3 |
pBM18ATopotsmart克隆试剂盒利用痘苗病毒的拓扑异构酶I(Topoisomerase I)的切割再连接的特点将片段克隆到载体中,不仅适用于克隆由Pfu、KOD、Xerox、Phusion和Q5等高保真DNA聚合酶扩增的平末端PCR产物,也可克隆由Taq、Tth和klenTaq等DNA聚合酶扩增的带A尾的PCR产物。阳性克隆可用M13F(-47)和M13R(-48) 引物进行菌落PCR鉴定。SmaI和XhoI单酶切可将克隆片段酶切出来。载体的多克隆位点两侧具有SP6和T7 RNA聚合酶启动子序列, 可用于体外RNA转录。载体不含LacZ基因,不能进行蓝白斑筛选。
产品特点:
1. 使用各种DNA聚合酶扩增的PCR产物。2. PCR 引物 5’端不能进行磷酸修饰,普通商业化引物即可。
3. 载体采用了新的制备工艺,无需蓝白斑筛选。
4. 载体具有氨苄青霉素抗性。操作步骤
1. 连接反应
按下表,在一个 0.2ml PCR 管中依次加入成分 | 体积 |
DNA 片段 | 0.5-8ml |
pBM18A Vector | 1ml |
10×Toposmart | 1ml |
补水至总体积 | 10ml |
加完试剂后,轻轻混匀低速离心,使溶液集中在管底。注意:此步骤不要在低温条件下(冰水浴)上操作。
注意:DNA 片段的用量见下表
室温下(20-30℃)反应时间 5-30 分钟,如果室温较低,推荐使用 PCR 仪控温。可以设置 25℃反应 5-30 分钟。如果 PCR 产物电泳检测仅有很锐利明亮的条带, 无引物二聚体和非特异性条带存在,可直接取 0.5-1ml 的 PCR 产物原液进行克隆。
20-30 分钟。
(2)42℃水浴中热击 30 秒。
(3) 立刻置于冰水浴中 2 分钟。
(4) 加入 300-500µl 无菌的不含抗生素的SOC 或 LB,37℃,200-250rpm 振荡培养 60 分钟。
注:小于 2kb 片段可以不复苏,直接涂平板。
(5) 吸取 200ml 菌液涂布。为了得到更多的菌落,可以先 4000rpm 离心 1 分钟,去掉部分上清,用移液器轻吹菌体,充分悬浮菌液,取全部菌液涂布,然后37℃培养过夜(12-16 小时)。
5. 阳性重组子的鉴定菌落 PCR
(1) 菌落PCR方法鉴定阳性克隆
2. 反应温度及片段要求
室温下(20-30℃)放置 5-30 分钟,然后将离心管放置在冰上。如当天不进行转化实验。请将连接产物置于-20℃保存。注意:DNA 片段的用量见下表
片段大小(bp) | 最佳用量(ng) |
100-1000 | 20-50 |
1000-2000 | 50-100 |
2000-5000 | 100-200 |
3. 阳性对照反应
取 1ml 试剂盒提供的 1kb 长度的对照片段 LacZ 基因 α肽片段进行克隆,转化具有α互补功能的大肠杆菌感受态细胞(如 DH5α,TOP10,Mach1T1 等)。菌液涂布在含有 IPTG 和 X-gal 的 LB 氨苄平板上,次日蓝色菌落为阳性克隆,说明有片段插入,白色菌落为空载体。4. 转化
(1)取 5ml 连接产物到 50-100ml 刚刚融化的感受态细胞中,轻轻混匀,冰浴20-30 分钟。
(2)42℃水浴中热击 30 秒。
(3) 立刻置于冰水浴中 2 分钟。
(4) 加入 300-500µl 无菌的不含抗生素的SOC 或 LB,37℃,200-250rpm 振荡培养 60 分钟。
注:小于 2kb 片段可以不复苏,直接涂平板。
(5) 吸取 200ml 菌液涂布。为了得到更多的菌落,可以先 4000rpm 离心 1 分钟,去掉部分上清,用移液器轻吹菌体,充分悬浮菌液,取全部菌液涂布,然后37℃培养过夜(12-16 小时)。
5. 阳性重组子的鉴定菌落 PCR
(1) 菌落PCR方法鉴定阳性克隆
① 用10ml吸头挑选克隆至预先加有10ml无菌水或LB培养基的PCR管中, 吹打混合。
② 25ml PCR反应体系:取2ml细菌悬液为模板、加入5mM 浓度的M13F(-47)、
M13R(-48)各1ml进行PCR扩增。
③PCR扩增条件:95℃预变性5分钟(裂解细胞,失活核酸酶),94℃变性10秒钟,55℃退火10秒钟,72℃延伸( 根据片段的大小决定延伸时间,通常每1min/1kb)X秒,30个循环,72℃后延伸5分钟。1%琼脂糖凝胶电泳分析扩增结果,有强烈的明显条带的克隆为重组体,与插入片段大小相近【M13F(-47)、M13R(-48)引物在克隆位置的两侧,所以PCR 扩增出的DNA的长度比插入片段大229bp】可视为阳性克隆。菌落PCR 方法鉴定重组子时一定要设立一个不加菌液的阴性对照。
(2) 测序:用M13F(-47)、M13R(-48)通用引物对阳性质粒进行测序分析。
pBM18A载体图谱7. 常见问题分析
(1) 重组子克隆菌少,或阳性率低:感受态效率低,使用转化效率>5×107cfu/µg 的感受态细胞
(2) 连接反应在低温下(如放碎冰上)操作,应该在室温下操作。
(3) PCR 片段加入量太多或太少,按照推荐量加入。
(4) PCR 纯度低,重新扩增或重新纯化 PCR 产物。
(5) PCR 质量低,切胶时在紫外下照射时间长,需重新制备。
(6) PCR 扩增结束后,应该再延伸 5-10 分钟,确保片段延伸完全。
(7) 转化后没有复苏培养,可以加入SOC 或 LB,培养 60 分钟。克隆基因可
② 25ml PCR反应体系:取2ml细菌悬液为模板、加入5mM 浓度的M13F(-47)、
M13R(-48)各1ml进行PCR扩增。
③PCR扩增条件:95℃预变性5分钟(裂解细胞,失活核酸酶),94℃变性10秒钟,55℃退火10秒钟,72℃延伸( 根据片段的大小决定延伸时间,通常每1min/1kb)X秒,30个循环,72℃后延伸5分钟。1%琼脂糖凝胶电泳分析扩增结果,有强烈的明显条带的克隆为重组体,与插入片段大小相近【M13F(-47)、M13R(-48)引物在克隆位置的两侧,所以PCR 扩增出的DNA的长度比插入片段大229bp】可视为阳性克隆。菌落PCR 方法鉴定重组子时一定要设立一个不加菌液的阴性对照。
(2) 测序:用M13F(-47)、M13R(-48)通用引物对阳性质粒进行测序分析。
6.
(1) 重组子克隆菌少,或阳性率低:感受态效率低,使用转化效率>5×107cfu/µg 的感受态细胞
(2) 连接反应在低温下(如放碎冰上)操作,应该在室温下操作。
(3) PCR 片段加入量太多或太少,按照推荐量加入。
(4) PCR 纯度低,重新扩增或重新纯化 PCR 产物。
(5) PCR 质量低,切胶时在紫外下照射时间长,需重新制备。
(6) PCR 扩增结束后,应该再延伸 5-10 分钟,确保片段延伸完全。
(7) 转化后没有复苏培养,可以加入SOC 或 LB,培养 60 分钟。克隆基因可
能对宿主菌有毒性,比如某些编码膜蛋白和DNA 结合蛋白的基因,某些启动子和调节序列基因,或含有倒置或串联重复序列的基因,选用室温过夜培养平板,或换用低拷贝质粒载体。
载体序列:
>pBM18A 1952bp AAAGGCCCACCCGTGAAGGTGAGCCAGTGAGTTGATTGCGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA AAACGACGGCCAGCCAATTGAAGCTATTTAGGTGACACTATAGATATCGAGCTCGAGGATCCATGGTACCCGGGCGTGTCG CGACACGCCCGGGTCTAGACTGCAGCTCGAGGCATGCAAGCT
TTGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAATTCCATCCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCGT CCATAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTTGATCGGCACGTAAGAGGTTCCAAC TTTCACCATAATGAAATAAGATCACTACCGGGCGTATTTTTTGAGTTATCGAGATTTTCAGGAGCTAA GGAAGCTAAAATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCCCTTATTCCCTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTC CTGTTTTTGCTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTG GGTTACATCGAACTGGATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCC AATGATGAGCACTTTTAAAGTTCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACGCCGGGCAAGAGC AACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTCAGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCAT CTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGCAGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGC CAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCTAACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATC ATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCATACCAAACGACGAGCGTGACACC ACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAACTACTTACTCTAGCTTC CCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCGCTCGGCCCTTC CGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGGTCTCGCGGTATCATTGCAGCA CTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGA TGAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAATGAGGGCCCAAAT GTAATCACCTGGCTCACCTTCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCC CCTGACGAGCATCACAAAAATCGATGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATA CCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACC TGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAGCGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCG GTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTGTGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTT ATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGACACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCCACTG GTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGAGTTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTAC GGCTACACTAGAAGAACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAGCCAGTTACCTCGGAAAAAGAGTT GGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTTGCAAGCAGCAGAT TACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAAGAAGATCCTTTGATTTTCTACCGAAG
本产品仅供研究,不用于临床诊断
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